فر را در دمای 180 درجه سانتی گراد تنظیم کنید.
یک لایه بادمجان را درون سینی فر بچینید، و اجازه دهید حدود 15 دقیقه بدون درب درون فر بپزد، سپس بادمجانها را برگردانده و 15 دقیقه دیگر به پختن ادامه دهد تا اندکی طلایی رنگ شوند. جهت خنک شدن آنها را 10 دقیقه کنار بگذارید.
در قابلمه ای گوجه فرنگی و شکر را بریزید و روی اجاق گاز قرار دهید تا به مدت 30 دقیقه تا بپزد تا گوجه فرنگی نرم شود و محلول تا حدودی تبخیر شود. در هنگام پخت گاهی آنها را هم بزنید.
قابلمه ی کوچکی حاوی مارگارین را روی حرارت بگذارید و صبر کنید تا ذوب شود، سپس آرد را بیفزایید و 1 دقیقه هم بزنید و شیر را کم کم اضافه کنید و روی حرارت متوسط محلول را هم بزنید تا بجوشد و به غلظت برسد، نصفی از پنیر و ریحان را درون محلول بریزید، مابقی ریحان را نیز به مخلوط گوجه فرنگی بیفزایید.
حدود 3/1 از مخلوط گوجه فرنگی، بادمجان و سس پنیر را درون ظرف پیرکسی که گنجایش 2 پیمانه را دارد بریزید، این کار را چندین مرتبه انجام و سپس بقیه پنیر را روی سطح مواد بریزید و اجازه دهید به مدت 15 دقیقه بپزد تا اندکی به رنگ طلایی درآید.
نکته: میتوانید 3 ساعت قبل از اینکه موساکا را بپزید مواد آن را درون ظرف بچینید و روی آن را پوشانده و درون یخچال نگه داری کنید.میتوانید از هر سبزیجاتی برای تزیین استفاده کنید